Le Lot regorge de milieux naturels exceptionnels, certains sont façonnés par les activités humaines depuis des siècles (pelouses, landes sèches, prairies) tandis que d’autres sont des éléments naturels et dynamiques (falaises, rivières, forêts, grottes).
Dans le cadre de Natura 2000, certains de ces milieux sont constitués d’habitats dits « intérêt communautaire », c’est-à-dire qu’ils sont mentionnés à l’annexe I de la Directive « Habitats, Faune, Flore ».